فیلم آموزش طراحی پرایمر با NCBI و Gene Runner

توضیحات "فیلم آموزش طراحی پرایمر با NCBI و Gene Runner" :

در فیلم آموزش طراحی پرایمر قصد داریم با استفاده از نرم افزار Gene Runner و سایت های NCBI و Primer3Plus نحوه طراحی پرایمر ژن را آموزش دهیم.

پرایمر ها DNA های تک رشته ای و کوتاهی هستند که عموما از هجده تا بیست و چهار باز آلی تشکیل می شوند. پرایمرها نقطه آغازین فرآیند سنتز DNA را تعیین می کنند و از طریق پیوند هیدروژنی به DNA تک رشته ای وصل می شوند. در داخل سلول ها، رشته های کوتاه RNA نقش آغازگر را ایفا می کنند. پس برای فرآیند PCR پس از اینکه ژن را تعیین کردیم باید پرایمرها طراحی شوند. برای تولید پرایمرها از آنزیم پریماز استفاده می شود، این آنزیم از دسته RNA پلیمرازها است. به این دلیل وجود پرایمر ضروری است که آنزیم DNA پلیمراز که در فرآیند DNA، PCR را سنتز می کند. تنها قادر است که نوکلئوتیدها را به رشته های DNA متصل کند و نه DNA های تک رشته ای. محدوده بین دو پرایمر توسط DNA پلیمراز پر می شود (به پرایمرها، پرایمرهای Forward و Reverse می گوییم). در نهایت این پرایمرها باید قبل از پایان یافتن سنتز DNA حذف شوند. پس طراحی پرایمرها باید به دقت انجام شوند. تولید آن ها به صورت تخصصی صورت می پذیرد تا به صورت دقیق بر روی توالی DNA های تک رشت های وصل شوند. همچنین از این پرایمرها برای تعیین توالی نیز استفاده می شود. DNA پلیمراز یا آنزیم Taq پلیمراز از طریق سر زنجیره OH-3 پرایمر به آن متصل می شود. 

در این دوره با استفاده از ابزارهای مختلف می آموزید که چطور پرایمر ژن ها را طراحی کنید. در فیلم آموزش طراحی پرایمر ابتدا به مباحث تئوری می پردازیم و سپس به زبانی ساده طراحی پرایمر در سایت NCBI را آموزش می دهیم. بعد از آن به طراحی پرایمر در سایت Primer3Plus پرداخته و در نهایت طراحی پرایمر با نرم افزار Gene Runner را می آموزید.

آنچه در فیلم آموزش طراحی پرایمر با NCBI و Gene Runner خواهید آموخت:

• مباحث تئوری طراحی پرایمر
• طراحی پرایمر با استفاده از سایت
• طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزار